このページでは、材料科学向けの3次元画像処理ソフトウェアの比較を行います。比較の対象として、3D Slicer、Amira/Avozo、Dragonfly、VGSTUDIO Maxを取り上げます。ImageJ(Fiji)…

動画の概要 この動画では、X線CT等で撮影した3相が混合したデータを想定して、フリーの3次元画像処理ソフトウェアである3D Slicerを用いて、Watershedセグメンテーションを行う方法を説明しています。Water…

動画の概要 この動画では、X線CT等で撮影した2つのボリュームデータの位置合わせを行い、どのような変形があったかを解析する方法を説明します。フリーの3次元画像処理ソフトウェアである3D Slicerでは、3次元の非線形レ…

動画の概要 この動画では、X線CT等で撮影したボリュームデータをセグメンテーションした後、四面体ボリュームメッシュを生成する方法を説明します。フリーの3次元画像処理ソフトウェアである3D Slicerでは、オープンソース…

方向ラベル(Orientation Marker) デフォルトでは、6面に方向ラベルがついています。 A,P,R,L,P,Iの意味は以下の通りです。 A = anterior P = posterior R = righ…

動画の概要 この動画では、粒子構造やポア構造を持つボリュームをX線CT等で撮影して、セグメンテーションした後、セグメントの表面積、形状モーメント、回転を考慮したバウンディングボックスなどを計算する方法を説明します。粒子構…

流体力学シミュレーションの材料評価への応用 材料の特性を測定する方法のひとつとして、流体がどれだけ通り抜けやすいか、というものがあります。測定には、実際に水や空気、油などの透過性を実験で測定する方法もありますが、X線CT…

Pythonでは基本的に、Global Interpreter Lockといって、一つのプロセスでしか動かせない、という制約がある。これは、複数スレッドを立ち上げてPythonコードを実行しようとしても、CPUでの計算を…

自分用のメモです。回転同士の距離がどういうものか、といったことはここに日本語で詳しく書いてあります(とても良いページ!)。 from pyquaternion import Quaternion import numpy…

はじめに 3次元回転(金谷健一著)を読んで、あるコスト関数を最小化するための3次元回転の最適化について、リー代数の方法、の理論的なところを少なくとも一部理解したので、実際に実装してみようというのが今回の目的。 リー代数と…