PythonでOpenCVを使うには import cv2 import numpy as np PythonとOpenCVのインストールの方法はこちらです。インストールが終わったなら早速始めてみましょう。OpenCVを…

マルチページTIFFをPythonで読み込むためにはPIL(Python Image Library)を用います。次のコードではマルチページTIFFの30枚目から100枚目までを読み込み、512*512ピクセルにリサイズ…

Pythonで連番画像を読み込む方法の紹介です。画像の読み込み自体はOpenCVのimread関数で行いますが、この関数にはファイル名の文字列を渡す必要があります。今回はPythonで連番ファイルの文字列を生成する方法の…

今回はPythonで厳密な重心を求める手法を紹介します。まずは重心の定義から見ていきましょう。C++版はこちら。 幾何学的には、ある図形の、そのまわりでの一次モーメントが 0 であるような点のこと。図形 D （およびその…

PythonとOpenCVを使った透視変換(Homography Transform)のコード例です。変換前後の4点ずつ、計8点からgetPerspectiveTransform関数によって3*3の変換行列を求め、war…

NVIDIA Jetson TK1 開発者用キットは、組み込みシステムアプリケーション用に GPU の能力を解き放つために必要なものすべてを提供します。革命的な NVIDIA Tegra® K1 SoCを中心に構築されて…

以下ではPythonで塩基配列を操作するコードを紹介します。説明は最小限に留めてありますが、C++がわかる人ならばPython初心者でも構文が似ているので意味はわかると思います。   1.DNA配列中の各塩基の…

画像を定量するときに、あるいは、機械学習の前処理をするときなどに、画像の明るさがバラバラだと、いくらその後の過程に手の込んだプログラムを用いてもうまい結果を出せないと思います。画像の明るさを揃えるためのコードを紹介します…

NumPyを使うと簡単に二次元配列を作ることができます。ここでは、NumPyのzeros関数を使って要素が全てゼロの配列を作っています。 import numpy as np array2d = np.zeros((4,…

今回はPythonで細胞数のカウントをしてみます。C++での粒子カウントを解説したものはこちらになります。 ヒト臍帯静脈内皮細胞 (HUVEC) CD31 の免疫蛍光染色　200× コスモバイオ 画像のチャンネル分離 c…